Kinnex full length RNA
Naše služba sekvenování full-length RNA Kinnex, poháněná platformou Revio PacBio, nabízí přesné a komplexní vhledy do transkriptomu.
Díky zachycení celých RNA molekul bez fragmentace nebo sestavování umožňuje tato služba detekci splice izoforem, genových fúzí, nespárovaných oblastí (UTR) a RNA modifikací. S technologií HiFi sekvenování získávají vědci bezkonkurenční přesnost a rozlišení pro transkriptomickou analýzu v různých biologických systémech.
Výhody sekvenování full-length RNA Kinnex
- Vysoká přesnost: HiFi čtení zajišťuje spolehlivou identifikaci a kvantifikaci izoform.
- Celé transkripty: Vyhněte se neúplným nebo fragmentovaným čtením, což zajišťuje komplexní pokrytí transkriptů.
- Epigenetické vhledy: Studujte RNA modifikace a jejich roli v regulaci genů a stabilitě.
- Škálovatelné řešení: Vhodné pro malé projekty nebo rozsáhlé transkriptomické studie.
- Komplexní podpora: Poskytujeme komplexní podporu pro váš výzkum, od kontroly vzorků až po pokročilou bioinformatiku.
Klíčové vlastnosti sekvenování full-length RNA Kinnex
Kompletní pokrytí transkriptů:
Zachyťte celé RNA molekuly, včetně složitých izoform, polyadenylačních míst a prodloužených UTR.
HiFi přesnost čtení:
Dosáhněte přesnosti >99,9 % pro spolehlivou detekci izoform, i v případě nízce přítomných transkriptů.
Žádná fragmentace ani sestavování:
Eliminujte zkreslení způsobená technologiemi s krátkými čteními a zachovejte původní strukturu transkriptů.
Epigenetické vhledy:
Současně detekujte RNA modifikace, jako je metylace m6A, pro funkční a regulační analýzu.
Široké transkriptomické vhledy:
Detekujte nové transkripty, alternativní splicingové události a genové fúze s vysokou citlivostí.
Aplikace sekvenování full-length RNA Kinnex
Objevování izoform
Výhody: Komplexní detekce a kvantifikace alternativních splicingových událostí.
Příklad použití: Anotace nových izoform ve špatně charakterizovaných genomech.
Profilování transkriptomů
Výhody: Kvantitativní a kvalitativní vhledy do celého transkriptomu.
Příklad použití: Analýza genové exprese specifické pro tkáně a objevování biomarkerů.
Detekce genových fúzí
Výhody: Přesná identifikace fúzních transkriptů u rakoviny a dalších nemocí.
Příklad použití: Objevování onkogenů a specifických RNA podpisů pro nemoc.
Epigenetika & modifikace
Výhody: Detekce RNA modifikací pro studium stability transkriptů a efektivity překladu.
Příklad použití: Analýza regulačních rolí RNA modifikací, jako je m6A, m5C a pseudouridin.
Analýza nekódující RNA
Výhody: Charakterizace dlouhých nekódujících RNA (lncRNA) a cirkulárních RNA.
Příklad použití: Funkční anotace regulačních RNA v genové expresi a vývoji.
Požadavky na vstup RNA pro sekvenování full-length RNA Kinnex
Kvalita a množství RNA jsou rozhodující pro úspěšné sekvenování full-length RNA. Následující tabulka shrnuje požadavky na vstup v závislosti na délce transkriptu:
Krátké (<1 kb)
Požadované množství vstupu: ≥ 50 ng RNA
Čistota (RIN): RIN ≥ 7
Doporučené QC metriky: Jasné RNA vrcholy na elektroforogramu
Poznámky: Vhodné pro menší mRNA a regulační RNA.
Střední (1–5 kb)
Požadované množství vstupu: ≥ 100 ng RNA
Čistota (RIN): RIN ≥ 8
Doporučené QC metriky: Intaktní RNA s minimálním poškozením
Poznámky: Ideální pro standardní profilování transkriptomu.
Dlouhé (5–10 kb)
Požadované množství vstupu: ≥ 200 ng RNA
Čistota (RIN): RIN ≥ 8
Doporučené QC metriky: Vysoce molekulární RNA s jasnými 28S/18S vrcholy
Poznámky: Nejlepší pro lncRNA, cirkulární RNA a prodloužené transkripty.
Velmi dlouhé (>10 kb)
Požadované množství vstupu: ≥ 500 ng RNA
Čistota (RIN): RIN ≥ 9
Doporučené QC metriky: Intaktní RNA bez viditelného poškození
Poznámky: Požadováno pro extrémně velké transkripty, jako jsou určité virové nebo rostlinné RNA.
Přehled pracovního postupu:
Příprava vzorku a QC
- Provedení kontroly kvality pro potvrzení integrity RNA, čistoty a koncentrace.
Syntéza cDNA
- Reverzní transkripce RNA do full-length cDNA pomocí PacBio specifických protokolů pro HiFi přípravu knihoven.
Příprava knihovny
- Konstrukce HiFi knihovny, která je optimalizovaná pro zachycení celých RNA molekul, včetně vzácných a dlouhých transkriptů.
Sekvenování Revio PacBio
- Generování vysoce přesných dlouhých čtení, zachycujících celé transkripty bez mezer nebo požadavků na sestavování.
Analýza dat
- Analýza izoform: Identifikace a kvantifikace splice izoforem a nových transkriptů.
- Profilování genové exprese: Analýza diferenciální exprese mezi vzorky nebo podmínkami.
- RNA modifikace: Detekce RNA modifikace a posouzení jejího funkčního dopadu.
- Funkční anotace: Integrace transkriptomických dat s analýzami drah a genové ontologie.
Začněte s námi
Odemkněte plný potenciál transkriptomického výzkumu s naší službou sekvenování full-length RNA Kinnex. Ať už studujete alternativní splicing, nové izoformy nebo RNA modifikace, naše platforma Revio PacBio poskytuje potřebnou přesnost a hloubku. Kontaktujte nás dnes, abyste prodiskutovali požadavky vašeho projektu, obdrželi přizpůsobenou cenovou nabídku a zjistili, jak můžeme urychlit vaše objevy.
Gene Omics s.r.o.
Republikánská 1218/6, Lobzy, 312 00 Plzeň
IČ: 22273310
Kontakty
info@geneomics.eu
+420 725 137 589
